Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME1Q06323 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms