Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSF1Q00613 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms