Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms