Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms