Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms