Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA5P28066 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms