Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms