Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms