Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms