Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms