Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms