Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4AP04350 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms