Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG7O95352 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms