Protein–RNA interactions for Protein: B1ANY3

FAM220BP, Putative protein FAM220BP, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220BPB1ANY3 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM220BPB1ANY3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms