Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms