Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms