Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PREBQ9HCU5 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PREBQ9HCU5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PREBQ9HCU5 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PREBQ9HCU5 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PREBQ9HCU5 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms