Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCD2Q9BXW9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCD2Q9BXW9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCD2Q9BXW9 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCD2Q9BXW9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCD2Q9BXW9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCD2Q9BXW9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCD2Q9BXW9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCD2Q9BXW9 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCD2Q9BXW9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCD2Q9BXW9 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCD2Q9BXW9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCD2Q9BXW9 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCD2Q9BXW9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCD2Q9BXW9 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCD2Q9BXW9 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCD2Q9BXW9 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCD2Q9BXW9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCD2Q9BXW9 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCD2Q9BXW9 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms