Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CECR2Q9BXF3 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms