Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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C9orf85Q96MD7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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C9orf85Q96MD7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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C9orf85Q96MD7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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C9orf85Q96MD7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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C9orf85Q96MD7 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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C9orf85Q96MD7 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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