Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms