Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms