Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGBD4Q96DM1 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms