Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2Q8WZ74 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms