Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms