Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.1 ms