Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VITQ6UXI7 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VITQ6UXI7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VITQ6UXI7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VITQ6UXI7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VITQ6UXI7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VITQ6UXI7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VITQ6UXI7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VITQ6UXI7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VITQ6UXI7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VITQ6UXI7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VITQ6UXI7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VITQ6UXI7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VITQ6UXI7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VITQ6UXI7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VITQ6UXI7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms