Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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PRAMEF20Q5VT98 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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