Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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