Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms