Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms