Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms