Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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