Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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