Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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