Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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