Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms