Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CKAP5Q14008 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CKAP5Q14008 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CKAP5Q14008 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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CKAP5Q14008 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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