Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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