Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BNIP3Q12983 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms