Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FOXF1Q12946 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FOXF1Q12946 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FOXF1Q12946 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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