Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PTPRJQ12913 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PTPRJQ12913 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PTPRJQ12913 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PTPRJQ12913 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PTPRJQ12913 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PTPRJQ12913 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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PTPRJQ12913 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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