Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms