Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NOMO3P69849 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms