Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK8P49336 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK8P49336 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK8P49336 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK8P49336 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK8P49336 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK8P49336 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK8P49336 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms