Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms