Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms