Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms