Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB2P29033 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms