Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms